Tot 22 september kunnen innovatieve projecten aangemeld worden via de website waterinnovatieprijs.nl . De inzendingen worden door een deskundige jury onder leiding van Lidewijde Ongering, secretaris-generaal van het ministerie van Infrastructuur en Milieu, beoordeeld op hun innovatieve, duurzame karakter en haalbaarheid als business-case.
Begin november worden de genomineerden bekend gemaakt, waarna het publiek de kans krijgt op hun favoriete innovatie te stemmen voor de Publieksprijs. De prijsuitreiking vindt plaats op maandag 27 november in de Rijtuigenloods te Amersfoort.